Juhataja: Arvo Tullus (arvo.tullus@ut.ee)
Rakendusökoloogia töörühm uurib erinevate ökosüsteemide (looduslik mets, metsakultuur, märgalad, degradeeritud maastikud) kohanemist keskkonnamuutustega (eelkõige kliima ja maakasutuse muutustega) ja analüüsib vastavasisuliste ökofüsioloogiliste alusuuringute tulemusi rakenduslikust aspektist, tehes järeldusi koosluste majandamiseks ja ökosüsteemi teenuste (nt. süsiniku sidumine ja kliima reguleerimine, rohtne ja puidupõhine biomass toorainena) tarbimiseks.